Uczulenie na klotrymazol lub którykolwiek z pozostałych składników tego leku, Clotidal może wpływać na działanie leków doustnych zawierających takrolimus lub syrolimus. Clotidal zmniejsza również skuteczność amfoterycyny i innych antybiotyków polienowych (np.nystatyny, natamycyny). Jednocześnie stosowane miejscowo leki zawierające silnie działające steroidy osłabiają działanie leku Clotidal. Nie należy stosować leku w okresie ciąży, należy zaprzestać karmienia piersią podczas leczenia lekiem Clotidal, może wywoływać miejscowe reakcje skórne, nie należy stosować leku podczas miesiączki, nie używać tamponów, irygacji pochwy, środków plemnikobójczych lub innych leków dopochwowych.
Lek może zmniejszać skuteczność i bezpieczeństwo stosowania produktów lateksowych. W związku z tym podczas stosowania leku Clotidal należy stosować dodatkowe metody antykoncepcji.